在非靶向代謝組學(xué)方法中，在一個(gè)樣本中研究了數(shù)千種代謝物。然而，該化合物的化學(xué)特性在靶向方法中并不為人所知。在研究期間或研究完成后獲取有關(guān)化合物的數(shù)據(jù)，這些信息用于注釋或確定代謝物。

為了最大限度地解釋樣品及其影響，以非靶向方法進(jìn)行穩(wěn)健的化合物鑒定。  通過可靠的識(shí)別或注釋，可以對(duì)單個(gè)研究進(jìn)行生物數(shù)據(jù)解釋，并且可以比較來(lái)自不同研究組的數(shù)據(jù)。

代謝物注釋和鑒定標(biāo)準(zhǔn)

代謝組學(xué)標(biāo)準(zhǔn)倡議 (MSI) 和代謝組學(xué)報(bào)告核心信息 (CIMR) 的化學(xué)分析工作組 (CAWG) 將代謝物分為四類。  他們是：

★ 1 級(jí)：已鑒定的代謝物

★ 級(jí)別 2：假定注釋的化合物

★ 第 3 級(jí)：假定表征的復(fù)合類別

★ 4級(jí)：未知化合物

研究人員在報(bào)告代謝物時(shí)需要清楚地區(qū)分和確定水平。 大多數(shù)已被鑒定、表征和報(bào)道的代謝物都是非新的。  第一次未識(shí)別的代謝物將根據(jù)與可靠樣品的共同表征進(jìn)行識(shí)別。  提供了已確定的 1 級(jí)非新型化合物的最低報(bào)告標(biāo)準(zhǔn)。無(wú)法在商業(yè)上獲得的代謝物被確定為推定的注釋化合物（2 級(jí)）。  這些代謝物沒有化學(xué)參考標(biāo)準(zhǔn)；  然而，它們是根據(jù)與光譜數(shù)據(jù)庫(kù)一致的物理化學(xué)特性來(lái)識(shí)別的。在光譜和化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)中，沒有為鑒定為假定特征化合物類別（3 級(jí)）的代謝物提出結(jié)構(gòu)。  這些化合物的識(shí)別取決于給定化學(xué)類別化合物的獨(dú)特物理化學(xué)相似性或光譜特性。

當(dāng)化合物未被識(shí)別或分類時(shí)，它們被稱為未知化合物（4 級(jí)），但可以根據(jù)可用的光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行區(qū)分和計(jì)算。

代謝物的命名

CAWG 支持識(shí)別新型代謝物的傳統(tǒng)原則，并建議研究人員按照國(guó)際純粹與應(yīng)用化學(xué)聯(lián)合會(huì) (IUPAC) 命名法命名該化合物。

對(duì)于非新型代謝物，IUPAC 提供了化合物分類的標(biāo)準(zhǔn)。  由于這些名稱冗長(zhǎng)且最復(fù)雜，因此它們被替換為短名稱和常用名稱。

下面提到的數(shù)字標(biāo)識(shí)符可用于引用化合物。

★ IUPAC 國(guó)際化學(xué)品標(biāo)識(shí)符 (InChI)

★ 具有生物意義的化學(xué)實(shí)體 (ChEBI)

★ 簡(jiǎn)化分子輸入線輸入規(guī)范 (SMILES)

★ 化學(xué)文摘社 (CAS)

★ PubChem 化合物標(biāo)識(shí)符 (CID)

★ 摩爾文件

CAS 編號(hào)的專有屬性使其不太受歡迎。通常首選 InChI、CID 和 SMILES 代碼。CAWG 建議使用 InChI 代碼，因?yàn)樗鼈儽阌跀?shù)據(jù)交換和與數(shù)據(jù)庫(kù)通信，并建議研究人員至少報(bào)告一個(gè) IUPAC 化學(xué)名稱或任何通用名稱以及已識(shí)別的代謝物的結(jié)構(gòu)代碼，以便公開它們。

對(duì)于未鑒定的代謝物，建立了報(bào)告它們的最低標(biāo)準(zhǔn)。  例如，對(duì)于所有未知的化合物，殺蟲劑或除草劑需要與內(nèi)源性代謝物徹底區(qū)分開來(lái)。

主要舉措

有許多重要的倡議和團(tuán)體致力于進(jìn)一步開發(fā)和應(yīng)用這些標(biāo)準(zhǔn)。

★ MetaboLights 是第一個(gè)滿足 MSI 報(bào)告元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的通用公共代謝組學(xué)存儲(chǔ)庫(kù)。  作者可以報(bào)告化合物的正確預(yù)期名稱，并將其映射到可用的代謝物數(shù)據(jù)庫(kù)，例如 ChEBI，并且還定義了置信水平。  分析元數(shù)據(jù)有助于跟蹤未知的化合物。

★ METLIN 是一個(gè)精選數(shù)據(jù)庫(kù)，提供多種搜索功能，包括對(duì)未知化合物表征的相似性搜索。

★ isoMETLIN 代謝物數(shù)據(jù)庫(kù)旨在用于基于同位素的代謝組學(xué)。  可以使用 isoMETLIN 識(shí)別包含同位素標(biāo)記的代謝物。  在 isoMETLIN 的幫助下，用戶可以搜索來(lái)自 METLIN 數(shù)據(jù)庫(kù)的超過 100 萬(wàn)個(gè)計(jì)算得到的同位素體。  根據(jù) 13C 或 15N 等特定同位素和質(zhì)荷比值，進(jìn)行搜索。

★ 代謝組學(xué)標(biāo)準(zhǔn)協(xié)調(diào) (COSMOS) 協(xié)助整個(gè)歐盟的數(shù)據(jù)提供者建立和推廣標(biāo)準(zhǔn)，以便更輕松地分發(fā)代謝組學(xué)數(shù)據(jù)。

★ Metabolomics Workbench 有助于更新可用的標(biāo)準(zhǔn)并創(chuàng)建代謝組學(xué)中缺少的標(biāo)準(zhǔn)。

★ 代謝組學(xué)學(xué)會(huì)發(fā)起了代謝物鑒定任務(wù)組和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)，以確保標(biāo)準(zhǔn)不斷發(fā)展以滿足未來(lái)的要求。  該協(xié)會(huì)的目標(biāo)是在參與標(biāo)準(zhǔn)制定的人員和其他利益相關(guān)者之間提供有效的溝通和協(xié)調(diào)。  代謝物鑒定工作組的作用是讓社區(qū)成員參與有關(guān)使用報(bào)告標(biāo)準(zhǔn)來(lái)鑒定化合物的活動(dòng)。

非靶向代謝組學(xué)服務(wù)信息

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非靶向代謝組學(xué)樣本要求

1. 送樣量要求

▲注意：為保證數(shù)據(jù)的可靠性，建議生物學(xué)重復(fù)不少于6個(gè)。其他未列明的樣本請(qǐng)?jiān)斣兛头蜾N售人員。

2. 樣本保存和運(yùn)輸要求

（1）樣本于-80℃冰箱中保存，干冰取樣/運(yùn)輸，請(qǐng)至少在送樣前一天通知我方；

（2）樣本一定要做好標(biāo)記，應(yīng)用油性防凍記號(hào)筆或標(biāo)簽紙?jiān)诠苌献⒚鳂颖久Q或編號(hào)；

（3）樣本較多或需要分批做，要將樣本分裝。